Le Musée archéologique expose essentiellement les objets archéologiques mis au jour dans le site de Lixus.
Les collections présentées couvrent une longue période de l'histoire du Maroc, allant de l'époque phénicienne jusqu'à l'époque islamique en passant par les époques carthaginoise, mauritanienne et romaine, le musée permet également de découvrir divers aspects du Maroc préislamique par ses nombreuses pièces de monnaie et quelques objets antiques.
Le Maroc islamique y est aussi largement représenté. On y trouve, entre autres, des pièces des dynasties Almohade et Mérinide…
